一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

“要是在游戲世界里，我就是英雄了！”被隊友背靠著背以一擋百，被美女們糾纏著手臂撒嬌，力戰惡龍挽救公主，相信每個宅男都有如此想過吧...主角風間良正是這樣子的一名宅男，在學校被同學欺凌，被愛慕的女神嫌棄，唯一能慰藉存在感的就只有游戲。把感情封鎖在心底深處，每日都幻想可以進入游戲世界里。他的愿望…竟然成真了

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。